蛋白-小肽复合物结构预测对于小肽的结构与功能研究、小肽药物筛选与优化十分重要。
我们提供了一种蛋白-小肽的对接工具,用户输入靶点蛋白(受体)的结构或序列,以及小肽的序列,即可获得蛋白-小肽复合物预测结构,以及结合界面残基能量贡献表,从中可得到热点残基信息,为小肽序列优化提供线索。
输入:靶点蛋白PDB结构文件或序列,小肽序列;
输出:最佳的10个靶点蛋白-小肽复合物结构以及打分文件。
其中靶点蛋白PDB结构文件可从PDB库(https://www.rcsb.org/)检索并下载获得,也可以选择直接输入序列。
每次对接实验耗费500点数,时间周期2-4小时左右。
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