- 详细介绍
- 实验案例
蛋白-RNA复合物三维结构预测对蛋白质功能与分子机制的研究十分重要。这里我们提供两种分子对接方式预测蛋白-DNA复合物三维结构。
(1) 全局对接：可根据用户上传受体蛋白质和DNA蛋白质的三维PDB结构文件，预测并输出能量打分最佳的10个复合物结构，并给出初步的对接结合模式分析和结构显示。
(2) 指定位点对接：如果用户有部分实验信息，可加入结合位点残基信息，进行局部分子对接；指定结合残基的对接准确性比全局对接更高。
输入：受体蛋白质PDB结构文件，DNA蛋白质PDB结构文件，位点信息(可选)；
输出：最佳的10个复合物结构，打分文件。
其中受体蛋白PDB结构文件、DNA蛋白PDB结构文件可从PDB库（https://www.rcsb.org/）检索并下载获得；若蛋白质仅有序列，可联系我们进行蛋白质结构的同源建模（info@pumeirui.com）。
每次对接实验耗费500点数，时间周期2-4小时左右。
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