快速建立合作: info@pumeirui.com
Edua

蛋白-DNA对接

9 人使用过此工具

蛋白质-DNA复合物结构预测工具

分类 : 生物大分子

  • 详细介绍
  • 实验案例
  • 客户评价

蛋白-RNA复合物三维结构预测对蛋白质功能与分子机制的研究十分重要。这里我们提供两种分子对接方式预测蛋白-DNA复合物三维结构。

(1) 全局对接:可根据用户上传受体蛋白质和DNA蛋白质的三维PDB结构文件,预测并输出能量打分最佳的10个复合物结构,并给出初步的对接结合模式分析和结构显示。

(2) 指定位点对接:如果用户有部分实验信息,可加入结合位点残基信息,进行局部分子对接;指定结合残基的对接准确性比全局对接更高。

输入:受体蛋白质PDB结构文件,DNA蛋白质PDB结构文件,位点信息(可选);

输出:最佳的10个复合物结构,打分文件。

 

其中受体蛋白PDB结构文件、DNA蛋白PDB结构文件可从PDB库(https://www.rcsb.org/)检索并下载获得;若蛋白质仅有序列,可联系我们进行蛋白质结构的同源建模(info@pumeirui.com)。

 

每次对接实验耗费500点数,时间周期2-4小时左右。

暂无相关评论~

发表您的评价

登录
还没有账号?注册

保持登录