- 详细介绍
- 实验案例
当知道确切的靶点蛋白后，需要对化学空间多样化的小分子化合物库进行系统的筛选，获得可能有活性的苗头分子。本工具提供基于深度学习算法的蛋白-小分子对接工具用于化合物库筛选，给出潜在活性小分子列表。
产品功能：(1) 根据用户上传的靶点蛋白质三维PDB结构文件以及内置化合物数据库，进行虚拟筛选。(2) 对小分子库采用基于知识的对接打分函数以及深度学习模型打分函数进行打分排序，给出潜在活性分子列表。
输入：受体蛋白质PDB结构文件，指定化合物数据库；
输出：最佳的1000个小分子对接构象，经典对接打分文件，及深度学习打分文件（可选）。
提供DrugBank，Specs和Chemdiv化合物库可选择：DrugBank库包含3110个已知药物分子，Specs库包括约20万个小分子，Chemdiv库包含160万个小分子。若用户有其他感兴趣化合物库可联系我们进行定制（info@pumeirui.com）。
DrugBank：1000点，Vina大约耗时1小时，Psdock大约耗时30分钟；
Specs：5000点， Vina大约耗时2天，Psdock大约耗时1天；
Chemdiv：10000点， Vina大约耗时5天，Psdock大约耗时3天。
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