当知道确切的靶点蛋白后,需要对化学空间多样化的小分子化合物库进行系统的筛选,获得可能有活性的苗头分子。本工具提供基于深度学习算法的蛋白-小分子对接工具用于化合物库筛选,给出潜在活性小分子列表。
产品功能:(1) 根据用户上传的靶点蛋白质三维PDB结构文件以及内置化合物数据库,进行虚拟筛选。(2) 对小分子库采用基于知识的对接打分函数以及深度学习模型打分函数进行打分排序,给出潜在活性分子列表。
输入:受体蛋白质PDB结构文件,指定化合物数据库;
输出:最佳的1000个小分子对接构象,经典对接打分文件,及深度学习打分文件(可选)。
根据化合物库的大小确定需耗费的算力以及消耗的点数,预计2000点起,时间周期12小时起。
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