药物研发过程中,发现一个化合物的作用靶点是非常重要的,许多天然产物、表型筛选活性分子的作用靶点尚不明确。本工具可以根据用户上传的目标分子结构,在化合物库中进行高效的相似性匹配与检索,旨在发掘与目标分子在结构上高度相似或具备相似生物活性的化合物,这些已知化合物所作用的靶标,极有可能也是目标分子潜在的相互作用靶点。
产品功能:(1)计算模版分子与化合物库(BindingDB、ChEMBL)中小分子之间的相似性得分。(2)可进行基于模版分子、待查询分子以及结合模版分子和待查询分子的打分方法进行相似性打分。
输入:模版分子(仅限1个小分子),选择化合物库。
输出:输出化合物库中小分子与模版分子的相似性打分,小分子活性值、靶点信息及疾病信息。
提供BindingDB和ChEMBL化合物库可选择: BindingDB库包含100多万个小分子, ChEMBL库包括200多万个小分子。若用户有其他感兴趣化合物库可联系我们进行定制(info@pumeirui.com)。
选择不同的化合物库需要消耗不同的点数和时间:
BindingDB :3000点,耗时约3小时左右;
ChEMBL :6000点,耗时约6小时左右。