小分子结构聚类可以帮助研究人员识别和分类具有相似生物活性或药理作用的小分子化合物,从而加速药物筛选和发现过程。本工具可根据用户上传小分子数据集,进行基于Murcko骨架或分子指纹的聚类分析,揭示小分子间的结构相似性和差异性,从而实现对小分子化合物的高效分类与结构特征提取。
产品功能:基于scaffold或分子指纹相似性的2D化学结构聚类分析。可用于在小分子化合物库中挑选代表结构,或对于已知活性分子进行结构-活性分析;也可用于虚拟筛选后处理,对潜在活性分子进行cherry-pick。
输入:小分子数据集(smi、sdf、mol2),选择聚类方法。
输出:小分子结构式,小分子名称和成簇ID。
免费供用户使用,时间周期由用户提供的小分子数据集大小确定,耗时3-5分钟。